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급여 정산은 단순한 계산 업무가 아니라, 근로기준법·최저임금법·국민연금법 등 수많은 법령을 한 번에 고려해야 하는 전문적인 컴플라이언스 작업입니다. 이를 어길 경우 과태료 부과, 근로감독관의 시정명령, 심지어 민사소송까지 이어질 수 있죠. 게다가 기업이 성장할수록 정규직·계약직·특수형태근로자·일용직·용역직·사업·기타소득자 등 다양한 고용 형태가 혼재하게 되어, 점검해야 할 항목은 더욱 복잡해집니다.
이 글을 통해 주요 리스크별로 꼭 확인해야 할 핵심 체크리스트를 단계별로 정리하고, 체계적인 관리로 급여 정산 오류를 미리 예방하는 방법을 안내해 드릴게요.
고용 형태별 4대 보험 기준
구분 | 의무가입대상 | 가입제외대상 | |
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일반 근로자 | 일용직 | ||
국민연금 |
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건강보험 |
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고용보험 |
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산재보험 |
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기타 유의 사항
외국인은 국적과 체류 자격에 따라 4대 보험 제외 처리나 의무 가입자가 아닐 수 있으니 이 점 참고하여 4대보험 신고를 진행하시는 것이 좋아요.
고용형태별 원천세율 차이
소득 유형 | 원천세율 |
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근로소득 | 과세소득에 따른 소득세율로, 근로소득간이세액표에 따른 세율 적용 |
사업소득 | 총급여의 3.3% |
일용소득 | 일당 150,000원 초과 시, 초과액의 2.97% |
기타소득 |
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겸직 근로자
2곳 이상의 회사에 근로를 제공하고 급여를 받는 겸직 근로자의 경우 두 회사 모두 4대 보험 취득 신고를 진행해야 해요. 국민연금의 경우 각 회사에서 받는 소득월액 총합을 기준으로 보험료가 정해져요. 건강보험은 각각 회사에서 받는 보수로 보험료를 산정하고 부과해요. 고용보험은 이중 취득이 되지 않고 한곳에서만 취득되는데, 이중 취득이 불가하다고 하여 임의로 취득 신고를 생략할 수는 없으니 주의하세요.
임원 급여 관리
임원은 일반 근로자와 달리 특별한 법적 지위를 가지기 때문에 급여 처리 시 별도의 기준을 적용해야 해요.
등기임원 vs. 미등기임원
등기임원은 근로기준법상 근로자가 아니므로 근로기준법의 보호를 받지 않아요. 따라서 최저임금법 적용이 되지 않아 무보수 계약도 가능해요. 반면 미등기임원은 실질적으로 근로를 제공하는 경우 근로자로 인정받을 수 있어 근로기준법이 적용돼요.
임원 퇴직금 계산 기준
등기임원의 퇴직금은 퇴직급여법이 아닌 상법에 따라 정관이나 주주총회 결의로 정해져요. 임원은 법인세법 및 소득세법의 임원 퇴직금 규정을 별도로 적용받는데요. 만약 정관이나 정관의 위임된 임원 퇴직급여 지급 규정에 따라 퇴직급여를 지급했다면 그 금액까지 퇴직소득으로 인정되고, 법인세법상 한도를 초과한 지급액은 상여로 소득 처분되어 근로소득세가 부과돼요.
법인세법상 한도를 초과하지 않더라도, 소득세법상 임원에게 지급하는 퇴직 소득금액이 아래 금액을 초과한다면 그 초과 금액은 근로소득으로 간주해서 소득세가 부과돼요.
임원 퇴직금 지급 시 지급 규정이 있는지에 따라 퇴직소득으로 인정받을 수 있는 범위가 달라지기 때문에 정관 내에 퇴직금 관련 규정 설정이 중요해요.
복리후생 제도 관련 특수사항
복리후생비는 과세 여부와 비과세 한도가 복잡하게 얽혀있어 정확한 기준 적용이 필요해요.
식대 지원 비과세 기준
식사 제공 시 월 20만 원 까지 비과세 적용이 가능해요. 식권으로 지급 시에도 동일하지만, 현금으로 지급하게 되면 과세 대상이니 주의해야 해요.
복리후생비 과세 여부 판단
영유아보육법에 따른 사업주가 부담하는 보육비용, 중소기업의 종업원이 주택의 구입, 임차 자금 대출로 얻는 이익 등은 비과세 소득이에요.
선택적 복리후생 제도의 과세 기준
선택적 복리후생 제도에 따른 복지포인트는 소득세법상 근로소득으로 과세돼요.
성과급 제도
성과급의 통상임금 포함 여부는 연장, 야간, 휴일 근로 수당 등 법정 수당 계산에 직접적인 영향을 미쳐요.
성과급 통상임금 포함 여부
근로자가 소정 근로의 대가로 정기적・일률적으로 지급되는 정기상여금은 통상임금에 해당해요. 통상임금에 포함되면 연차수당, 초과근로수당 등의 수당 계산 시 영향을 주기 때문에 정확한 판단이 필요해요.
퇴직금 계산
퇴직금 계산 시 평균임금 산정 기준을 정확히 적용해야 과소 또는 과다 지급을 방지할 수 있어요.
평균임금 산입 항목
평균임금 산정 사유 발생일 이전 1년간 지급된 연차수당에 대해서만 평균임금에 포함돼요. 퇴직 사유로 지급된 연차수당은 평균임금에 포함하지 않아도 돼요. 상여금은 지급 시기와 성격에 따라 산입 여부가 결정돼요. 취업규칙・단체협약에 따라 미리 지급 조건이 명시됐거나 관례적으로 계속해서 지급해 왔다면 평균임금에 산입되나, 지급 여부가 불확실한 상여금은 평균임금에 포함되지 않아요.
통상임금 vs. 평균임금 비교 적용
퇴직금은 통상임금과 평균임금 기준 중 근로자에게 유리한 금액으로 지급해야 해요. 통상적으로 평균임금이 더 높으나 특수한 상황에서 낮게 계산될 경우가 발생할 수 있어 반드시 비교해야 해요.
중간 정산 이력
퇴직금 중간 정산은 근로자가 특정 사유로 퇴직하기 전에 퇴직금을 미리 정산하는 제도인데요. 이력이 있는 경우 최종 퇴직 시 중간 정산 이후 기간부터 새로 계산하여 정산해야 해요. 중간 정산 이력을 정확히 관리하여 중복 지급을 방지해야 해요.
원천징수
원천징수 오류는 연말정산 시 근로자에게 큰 세금 부담으로 이어질 수 있어 세심한 관리가 필요해요.
원천징수 세율 조정
근로소득간이세액표의 세율 구간을 정확히 적용해야 해요. 중소기업 감면 세액 적용 시 감면 기간이 지났음에도 매달 공제되지 않도록 주의가 필요해요.
인적공제 오적용
인적공제 공제 수를 잘못 적용하거나, 공제 요건을 만족하지 않는 가족을 포함하거나, 중복으로 적용하는 경우가 없도록 해야 해요.
비과세 소득 기준 착오
자녀 양육 수당, 국외 근로소득, 직무발명 보상금 등의 비과세 기준을 정확히 적용해야 해요. 한도 초과분에 대해서는 과세로 처리되니 주의해야 해요.
4대 보험
4대 보험 신고 오류는 과태료뿐만 아니라 근로자의 급여에도 직접적인 영향을 미쳐요.
보수 신고 정확성
취득 신고 시 잘못된 보수 신고는 4대 보험료가 잘못 고지될 수 있기 때문에 정확한 보수로 신고될 수 있도록 주의해야 해요.
등기임원 4대 보험
대표 및 등기임원은 고용보험과 산재보험은 의무 가입 대상이 아니에요. 인지하지 못하고 취득 신고를 진행하셨다면 취득 취소 신고를 통해 오공제 됐던 고용보험 공제분과 납부된 회사부담분에 대해 환급받아보세요.
취득, 상실 신고 기한
건강보험 취득 신고는 입사일로부터 14일 이내, 그 외 4대 보험은 입사 월의 다음 월 15일까지 신고해야 해요. 건강보험 상실 신고는 퇴사일로부터 14일 이내, 그 외 4대 보험은 퇴직 월의 다음 월 15일까지 신고해야 해요. 기한을 넘기면 과태료가 부과되니 일정 관리가 중요해요.

전문가에게 맡기는 완벽한 급여 컴플라이언스
급여 업무는 단순한 계산 작업이 아니라 다양한 법령을 종합적으로 고려해야 하는 전문적인 컴플라이언스 업무예요. 체계적인 체크리스트를 통해 핵심 리스크 요소들을 사전에 점검할 수 있어요. 이러한 예방적 관리를 통해 정산 오류로 인한 법정 분쟁・과태료 부과 등을 미리 방지하고, 지속적인 모니터링과 개선을 통해 완성도 높은 급여 관리 체계를 구축해야 합니다.
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